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Todas las secuencias que se generaron y utilizaron en el presente estudio se enumeran en las Tablas suplementarias 1-3 (accesibles en el repositorio de GitHub) junto con sus ID de secuencia GISAID, las fechas de muestreo, los laboratorios de origen y de envío y los autores principales. Todos los archivos de entrada (por ejemplo, alineaciones o archivos XML), todos los archivos de salida resultantes y los scripts utilizados en el estudio se comparten públicamente en GitHub (https://github.com/genomicsurveillance/Genomic_epidemiology_reveals_how_restriction_measures_shaped_the_SARS-CoV-2_epidemic_in_Brazil).
Nat Microbiol 7, 1490-1500 (2022). https://doi.org/10.1038/s41564-022-01191-zDownload citationShare this articleCualquier persona con la que compartas el siguiente enlace podrá leer este contenido:Get shareable linkSorry, a shareable link is not currently available for this article.Copy to clipboard
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ResumenEl código de barras del ADN se ha utilizado ampliamente para resolver cuestiones taxonómicas e identificar nuevas especies. Los peces neotropicales se encuentran en una amplia variedad de formas y tamaños, con un gran número de especies aún por describir, muchas de las cuales son muy difíciles de identificar. Characidae es la familia más rica en especies de los Characiformes, y muchos de sus géneros están afectados por incertidumbres taxonómicas, incluido el género Astyanax, ampliamente distribuido y rico en especies. En este estudio, presentamos un extenso análisis de Astyanax que abarca casi toda su área de presencia, basado en códigos de barras de ADN. El uso de diferentes enfoques (ABGD, GMYC y BIN) para la agrupación de las secuencias reveló una amplia coherencia en los resultados obtenidos por el valor de corte inicial del 2% de divergencia para las especies putativas en el análisis Neighbor-Joining utilizando el modelo Kimura-2-parameter. Los resultados indican la existencia de cinco linajes de Astyanax. Algunos grupos, como el compuesto por las formas transandinas, están formados en su mayoría por especies bien definidas, y en otros se agrupan varias especies nominales, lo que dificulta la delimitación de las especies, que en muchos casos resultó imposible. Los resultados confirman la extrema complejidad de la sistemática del género Astyanax y demuestran que el código de barras del ADN puede ser una herramienta útil para abordar estas complejas cuestiones.
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ResumenTípicamente, los bancos centrales utilizan diversos modelos individuales (o una combinación de modelos) a la hora de predecir las tasas de inflación. La mayoría de ellos requieren una cantidad excesiva de datos, tiempo y capacidad de cálculo, elementos todos ellos escasos cuando las autoridades monetarias se reúnen para decidir sobre las intervenciones de política. En este trabajo utilizamos una técnica de combinación bayesiana móvil que considera las estimaciones de inflación realizadas por el personal del Banco Central de Colombia durante 2002-2011 como información previa. Nuestros resultados muestran que: 1) la precisión de los modelos individuales mejora al utilizar una metodología de contracción bayesiana, y 2) las priors compuestas por las estimaciones del personal superan a todas las demás priors que comprenden ponderaciones iguales o de vector cero. En consecuencia, nuestro modelo proporciona previsiones fácilmente disponibles que superan a todos los modelos individuales en términos de precisión de las previsiones en cada horizonte evaluado.
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Parutto, P., Heck, J., Lu, M., Kaminski, C., Avezov, E., Heine, M., y Holcman, D. (2022). High-throughput super-resolution single-particle trajectory analysis reconstructs organelle dynamics and membrane reorganization. Cell Reports Methods 2, 100277. https://doi.org/10.1016/J.CRMETH.2022.100277.
Chyi Wei Chung, Amberley D. Stephens, Tasuku Konno, Edward Ward, Edward Avezov, Clemens F. Kaminski, Ali A. Hassanali, y Gabriele S. Kaminski Schierle, Intracellular Aβ42 Aggregation Leads to Cellular Thermogenesis, Journal of the American Chemical Society (2022) 144 (22), 10034-10041DOI: 10.1021/jacs.2c03599
E. P. Melo, T. Konno, I. Farace, M. A. Awadelkareem, L. R. Skov, F. Teodoro, T. P. Sancho, A. W. Paton, J. C. Paton, M. Fares, P. M. R. Paulo, X. Zhang, E. Avezov, Stress-induced protein disaggregation in the endoplasmic reticulum catalysed by BiP. Nature Communications. 13, 2501 (2022). doi: 10.1038/s41467-022-30238-2
Eduardo Pinho Melo, Ilaria Farace, Tasuku Konno, Mosab Ali Awadelkareem, Lise R.Skov, Teresa P. Sancho, Adrienne W. Paton, James C. Paton, Matthew Fares, Pedro M. R. Paulo, Xin Zang, Edward Avezov: Stress-induced protein disaggregation in the Endoplasmic Reticulum catalysed by BiP, bioRxiv 2021.05.09.442953; doi: https://doi.org/10.1101/2021.05.09.442953
